Работа лаборатории направлена на разработку персонализированных решений в области регенеративной медицины и наномедицины, а ожидаемые результаты внесут значительный вклад в реализацию ее приоритетов в ближайшие годы. Для достижения целей лаборатории были поставлены следующие задачи:
- Разработка эффективного способа усиления накопления и выделения МСВ;
- Установление состава МСВ, включая анализ липидного и белкового профиля, РНК секвенирование;
- Выявление молекулярных особенностей взаимодействия МСВ с иммунными клетками;
- Разработка автоматизированного комплекса с помощью трехмерной ультразвуковой системы и сверточных нейронных сетей;
- Модификация их поверхности для обеспечения направленной доставки в место повреждения хрящевой ткани и переключения фенотипа иммунных клеток;
- Разработка метода управления ими внешним магнитным полем;
- Установление тропности разработанной наносистемы, ее безопасности и эффективности в животной модели (крысы, бараны/минипиги).
O ЛАБОРАТОРИИ
ЛАБОРАТОРИЯ КЛИНИЧЕСКИХ СМАРТ-НАНОТЕХНОЛОГИЙ
структура
СТРУКТУРА Лаборатории
Лаборатория располагается на 11 этаже Научно-технологического Парка биомедицины ФГАОУ ВО Первый МГМУ имени И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет); по адресу г. Москва, ул. Трубецкая, 8 в помещениях Института регенеративной медицины.
Забор биообразцов для работы лаборатории осуществляет Биобанк Научно-технологического Парка биомедицины ФГАОУ ВО Первый МГМУ имени И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет). У сотрудников лаборатории есть доступ комплексу чистых помещений GLP/GCP вивария ФГАОУ ВО Первый МГМУ имени И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет), кафедре травматологии, ортопедии и хирургии катастроф Университетской клинической больницы ФГАОУ ВО Первый МГМУ имени И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет).
У сотрудников лаборатории есть доступ к следующему уникальному оборудованию:
- многофункциональная система исследования методом спектроскопии рамановского рассеяния (ООО «Инсайнс солюшенс», Россия),
- конфокальный микроскоп LSM 880 с модулем AiryScan и GaAsP детектором (Carl Zeiss, Германия),
- флуоресцентный инвертированный микроскоп Axio Observer (Carl Zeiss, Германия), совмещенный с атомно-силовым микроскопом Bioscope Resolve (Bruker), мультифункциональный планшетный ридер Victor X3 (PerkinElmer, Германия),
- система для проведения вестерн-блоттинга (ThermoFisher, США),
- система гель-хемидокументирования iBright (Thermo Fisher Scientific, Сингапур),
- система ПЦР в реальном времени StepOnePlus (Applied Biosystems, США),
- амплификатор детектирующий «ДТпрайм» (ООО «НПО ДНК-Технология», Россия),
- микрофлюидный клеточный сортер SH800 (Sony Biotechnlogy, Япония),
- лазерный BioDrop (Сеченовский университет – Институт фотонных технологий, Россия) и экструзионный BioX (CellInk, США) биопринтеры,
- ультрацентрифуга (Beckman Coulter, США),
- роторно-вакуумный испаритель (Heidolph, Германия),
- лиофильная сушка (Labconco, США),
- совмещенная ДСК-ТГ-ИК-установка, включающая ИК микроскоп (PerkinElmer, США), КР- и ИК-спектрометры,
- система электропорации Neon (Invitrogen, США),
- система динамического светорассеяния с Nano Zetasizer (Malvern Panalytical, Великобритания),
- система обработки плазмой CUTE-1MPR (FemtoScience, Южная Корея),
- система ВЭЖХ, оснащенная гибридным квадрупольно-времяпролетным масс-спектрометром (ThermoFisher, США),
- мультиплексный анализатор MagPix (Merck, США),
- автоматический биохимический и иммуноферментный анализатор CHEM WELL 2910 (Awareness Technology, США),
- система высокоинформативного скрининга с конфокальной приставкой и функцией инкубации CellInsight CX7 (ThermoFisher, США)
- компьютерный микротомограф высокого разрешения Skyscan 1276 (Bruker) с системой лабораторной анестезии
- оборудование для определения макро- и микромеханических свойств: наноиндентер Piuma (Optic 11, Нидерланды), испытательные установки (Shimadzu, Япония; Biomomentum, Канада), реометр Physica MCR 302 (Anton Paar, Австрия).
Сотрудники
Ведущие ученые
Сотрудники ЛАБОРАТОРИИ
Достижения
Достижения и публикации
Результаты работы по проекту за 2021 год
- Выделены и комплексно охарактеризованы культуры мультипотеных мезенхимных стромальных клеток (ММСК) и хондроцитов из материала от 3 доноров, проведена дифференцировка ММСК в хондрогенном, остеогенном и адипогенном направлениях (по фенотипу и иммунофенотипу).
- Разработан способ стимулирования накопления внеклеточного матрикса (ВКМ) в монослойной 2D культуре с применением карргинан в комбинации с L-аскорбиновой кислотой
- Установлено накопление, созревание и распределение ВКМ в 2Д и 3Д культурах ММСК из пупочного канатика, проведен сравнительный анализ для данной культуры.
- Оптимизирован и успешно применен к 2D и 3D культурам фибробластов мыши линии 3Т3 и ММСК способ децеллюляризации и ферментирования ВКМ. Разработана технология получения наночастиц для последующей модификации матрикс-связанных везикул (МСВ).
- Показана разница в концентрации и пиковых диаметрах МСВ от различных типов клеток и при культивировании в 2D или в 3D условиях, с двухкратным увеличением выхода МСВ из 3D культур. Кроме того, разработаны биосенсоры для визуализации нановезикул с применением Рамановской микроскопии. Также усовершенствован метод ТГц микроскопии с субволновым пространственным разрешением для исследования биораспределения разработанных нанокомпозитов на животных моделях
- Разработан протокол биобанкирования МСВ с сохранением концентрации, диаметра и дзета-потенциала через 4 месяца хранения материала.
- Проанализированы данные литературы и выбрана оптимальная, на данный момент классификация данных МРТ тазобедренного сустава Hip Osteoarthritis MRI Scoring System (HOAMS), позволяющая разделить патологии по степеням.
- На базе ФГБУН ФИЦ Химической физики им. Н.Н. Семенова РАН установлены параметры среды сверхкритического диоксида углерода для эффективной децеллюляризации внеклеточного матрикса с сохранением МСВ, показано, что полнота децеллюляризации зависит таже от типа биологического материала.
Результаты работы по проекту за 2022 год
- Выделены и комплексно охарактеризованы пробы МСВ от разных типов клеток, как специфические медиаторы матрикс опосредованной межклеточной коммуникации; показано влияние МСВ на миграцию и дифференцировку клеток.
- На основе анализа протеомного липидного и транскриптомного профиля МСВ и анализа литературы по взаимодействию внеклеточных везикул с мембранами клеток разработаны подходы моделирования многоступенчатого процесса слияния нановезикул с мембранами клеток.
- Установлена роль структуры, пористости и механических свойств внеклеточного матрикса в пассивном транспорте и диффузии внеклеточных везикул. Проанализирована роль специфических поверхностных белков внеклеточных везикул в активном взаимодействии с компонентами внеклеточного матрикса.
- Разработаны протоколы получения, культивирования поляризации и характеризации макрофагов из мононуклеарных клеток периферической крови человека. Изучено влияние МСВ на играющие ключевую роль в дегенеративно-дистрофических заболеваний суставов воспалительные реакции по регуляции активности макрофагов. Установлено снижение провоспалительной активности М1 макрофагов в присутствии МСВ.
- Получены водные/фосфатно буферные дисперсии с гомогенно распределенными частицами для создания биосовместимых образцов магнитных наночастиц (МНЧ). Исследованы структура, размеры и формы агрегатов МНЧ, содержащих магнитное ядро, защитную оболочку и функциональные молекулы. Выявлено влияние переменного поля на параметры намагничивания, а также проведена оценка критических значений внешнего поля. Получены комплексы МСВ с МНЧ. Установлено, что используемые МНЧ не оказывают цитотоксического эффекта.
- Для ранней диагностики, прогнозирования развития остеоартрита и оценки эффективности терапии усовершенствован созданный уникальный компьютерный анализатор экспертного уровня на основе искусственного интеллекта. Расширена и дополнена база данных изображений МРТ тазобедренного сустава. С применением компьютерной модели автоматического определения патологии тазобедренного сустава проанализировано более 3000 клинических случаев. Проанализировано влияние связанных с полом гормональных, анатомических и биохимических параметров на патогенез остеоартрита.
- Исследования с применением уникального компьютерного анализатора экспертного уровня на основе искусственного интеллекта для автоматического определения патологии тазобедренного сустава провели согласно международным общепринятым классификациям. Провели сравнительный анализ различных классификаторов и различных методов выбора линейных объектов в текстурном анализе, оценили их применимость для автоматической диагностики.
- Проведены расчеты для неинвазивной регистрации МНЧ с МСВ с помощью датчиков магнитного поля. Установлено, что агрегаты могут испытывать броуновский процесс релаксации в низкочастотных магнитных полях и осуществлять локальную деформацию оболочек, в которые инкапсулированы МНЧ благодаря магнитомеханическому эффекту. Измерением намагниченности получена информация о пространственном распределении МНЧ с МСВ в области воздействия.
- Найдены оптимальные концентрации для визуализации модифицированных МСВ in vivo методом рентгеновской микротомографии.
- На базе ФГБУН Федеральный исследовательский центр химической физики им. Н.Н. Семенова РАН установлены параметры среды сверхкритического диоксида углерода для модификации МСВ МНЧ с сохранением структуры МСВ, проанализированы влияние природы магнетиков МНЧ и подходов введения МНЧ на модификацию МСВ.
Результаты работы по проекту за 2023 год
- Проведен анализ биораспределения разработанных нанокомпозитов в животной модели (крысы). Получены магнитные наносистемы из нанокомпозитов на основе матрикс-связанных везикул (МСВ) модифицированных магнитными наночастицами (МНЧ). Проанализированы данные литературы и предложены различные модификации нанокомпозитов для адресной доставки, в том числе непосредственно в органеллы клеток. Определены параметры визуализации магнитных наносистем в биообъектах методом рентгеновской микротомографии.
- Разработана модель остеоартрита у малых (крысы) и крупных (бараны/минипиги) животных. С учетом анатомических особенностей расположения менисков, а также связок коленного сустава наиболее удобной для выполнения оперативного вмешательства по моделированию остеоартрита у малых лабораторных животных является медиальная менискэктомия. В качестве модели остеоартрита крупных лабораторных животных выбрана передняя медиальная менискэктомия.
- Проведен анализ безопасности модифицированных нановезикул в модели остеоартрита у крыс. Установлены локальное присутствие введенных нанокомпозитов в областях введения без миграции по кровеносным сосудам и в другие органы и ткани.
- Анализ эффективности модифицированных МСВ в экспериментальной модели повреждения хрящевой ткани у крупных животных.
- Анализ тропности к месту повреждения хрящевой ткани исследуемого сустава разработанной наносистемы в животной модели (крысы). Определены параметры магнитного поля для векторного управления нанокомпозитами в биообъектах. Разработан и запатентован пленочный датчик для неинвазивной регистрации магнитного поля в биологическом объекте, позволяющий проводить измерения в большом диапазоне величин магнитного поля, имеющий небольшие размеры и низкий уровень пороговой чувствительности по магнитному полю и потоку, что позволяет идентифицировать источники, имеющие небольшие пространственные размеры (объемы), генерирующие слабые значения магнитного поля.
- Разработка автоматической классификации адекватности МРТ тазобедренного сустава. Разработка методов автоматической диагностики патологии тазобедренного сустава по снимкам МРТ с использованием методов машинного обучения (включая модели сверточных нейронных сетей глубокого обучения). Сформирована база МРТ-исследований, обработано более 4000 МРТ- исследований тазобедренного сустава с аннотированием и разделением изображений на релевантные и нерелевантные. Произведено масштабирование и препроцессинг данных для подготовки их к обучению нейронной сети.
- Описание разработанной контролируемой структуры глубокого обучения с использованием сверточной нейронной сети для ее классификации. Описание результатов обучения моделей на базе собранного датасета, анализ возможности интерпретации решений, генерируемых нейронной сетью. Построена и обучена модель на основе сверточной нейронной сети (CNN). После первоначального тестирования был проведен процесс оптимизации и настройки гиперпараметров модели. Провели анализ процесса, как модель делает свои предсказания. Результаты показали, что модель опирается на ожидаемые и понятные признаки для принятия решений, что увеличивает доверие к ее предсказаниям.
- На базе ФГБУН Федеральный исследовательский центр химической физики им. Н.Н. Семенова РАН установлены параметры среды сверхкритического диоксида углерода для одностадийного создания диперсной функциональной фракции МСВ.
Публикации
- Kornilova, A.V.; Novikov, S.M.; Kuralbayeva, G.A.; Jana, S.; Lysenko, I.V.; Shpichka, A.I.; Stavitskaya, A.V.; Gorbachevskii, M.V.; Novikov, A.A.; Ikramova, S.B.; Timashev, P.S.; Arsenin, A.A.; Volkov, V.S.; Vasilev, A.N.; Timoshenko, V.Yu. “Halloysite Nanotubes with Immobilized Plasmonic Nanoparticles for Biophotonic Applications”. Appl. Sci. 2021, 11 (10), 4565. https://doi.org/10.3390/app11104565 (IF JCR 2.679, CiteScore2021 3.7, Q2).
- Zhelnov, V. A.; Zaytsev, K. I.; Kucheryavenko, A. S.; Katyba, G. M.; Dolganova, I. N.; Ponomarev, D. S.; Kurlov, V. N.; Skorobogatiy, M.; Chernomyrdin, N. V. "Object-dependent spatial resolution of the reflection-mode terahertz solid immersion microscopy". Opt. Express. 2021, 29 (3), 3553-3566. https://doi.org/10.1364/OE.415049 (IF JCR 3.894, CiteScore2021 7.3, Q1).
- Lychagin, A.; Cherepanov, V.; Lipina, M.; Tselisheva, E.; Yurku, K.; Yavlieva, R.; Korkunov, A.; Vyazankin, I. “Prognostic role of affected side of the sacroiliac joint in pain recurrence after total hip arthroplasty with prior manual correction of iliosacral dislocation: prospective randomized clinical study”. International Orthopaedics 2022, 46 (3), 541-548. https://doi.org/10.1007/s00264-021-05240-w (IF JCR 3.075, CiteScore2021 5.8, Q1).
- Chailakhyan, R.K.; Kon, E.; Shekhter, A.B.; Ivannikov, S.V.; Telpukhov, V.I.; Grosheva, A.G.; Suslin, D.S.; Vorobieva, N.N.; Gerasimov, Yu.V.; Churbanov, S.N.; Kotova, S.L.; Fayzullin, A.L.; Lychagin, A.V.; Lipina, M.M.; Timashev, P.S. “Autologous bone marrow-derived mesenchymal stem cells provide complete regeneration in a rabbit model of the Achilles tendon bundle rupture”. International Orthopaedics 2021, 45, 3263–3276. https://doi.org/10.1007/s00264-021-05168-1 (IF JCR 3.075, CiteScore2021 5.8, Q1).
- Gerasimenko, A.Y.; Kuksin, A.V.; Shaman, Y.P.; Kitsyuk, E.P.; Fedorova, Y.O.; Sysa, A.V.; Pavlov, A.A.; Glukhova, O.E. “Electrically Conductive Networks from Hybrids of Carbon Nanotubes and Graphene Created by Laser Radiation”. Nanomaterials 2021, 11 (8), 1875. https://doi.org/10.3390/nano11081875 (IF JCR 5.076, CiteScore2021 6.6, Q1).
- Fayzullin, A.; Churbanov, S.; Ignatieva, N.; Zakharkina, O.; Tokarev, M.; Mudryak, D.; Khristidis, Y.; Balyasin, M.; Kurkov, A.; Golubeva, E.N.; Aksenova, N.A.; Dyuzheva, T.; Timashev, P.; Guller, A.; Shekhter, A. “Local Delivery of Pirfenidone by PLA Implants Modifies Foreign Body Reaction and Prevents Fibrosis”. Biomedicines 2021, 9 (8), 853. https://doi.org/10.3390/biomedicines9080853 (IF JCR 6.081, CiteScore2021 3.0, Q1).
- Tan, H.; Zhang, M.; Wang, Y.; Timashev, P.; Zhang, Y.; Zhang, S.; Liang, X.-J.; Li, F. “Innovative nanochemotherapy for overcoming cancer multidrug resistance”. Nanotechnology 2022, 33, 052001. https://doi.org/10.1088/1361-6528/ac3355 (IF JCR 3.874, CiteScore2021 6.2, Q2).
- Wang, Y.; Xia, B.; Huang, Q.; Luo, T.; Zhang, Y.; Timashev, P.; Guo, W.; Li, F.; Liang, X.-J. “Practicable Applications of Aggregation-Induced Emission with Biomedical Perspective”. Adv. Healthcare Mater. 2021, 10 (24), 2100945. https://doi.org/10.1002/adhm.202100945 (IF JCR 9.933, CiteScore2021 15.2, Q1).
- Rabchinskii, M.K.; Sysoev, V.V.; Glukhova, O.E.; Brzhezinskaya, M.; Stolyarova, D.Yu.; Varezhnikov, A.S.; Solomatin, M.A.; Barkov, P.V.; Kirilenko, D.A.; Pavlov, S.I.; Baidakova, M.V., Shnitov, V.V.; Struchkov, N.S.; Nefedov, D.Yu.; Antonenko, A.O.; Cai, P.; Liu, Z.; Brunkov, P.N. “Guiding Graphene Derivatization for the On‐Chip Multisensor Arrays: From the Synthesis to the Theoretical Background”. Advanced Materials Technologies 2022, 2101250. https://doi.org/10.1002/admt.202101250 (CiteScore2021 11.9, Q1).
- Peshkova, M.; Lychgin, A.; Lipina, M.; Di Matteo, B.; Anzillotti, G.; Ronzoni, F.; Kosheleva, N.; Shpichka, A.; Royuk, V.; Fomin, V.; Kalinsky, E.; Timashev, P.; Kon, E. “Gender-related aspects in osteoarthritis development and progression: a review”. International Journal of Molecular Sciences 2022, 23(5), 2767. https://doi.org/10.3390/ijms23052767 (CiteScore2021 6.9, Q1).
- Zurina, I.M.; Presniakova, V.S.; Butnaru, D.V.; Timashev, P.S.; Rochev, Y.A.; Liang, X. J. “Towards clinical translation of the cell sheet engineering: Technological aspects”. Smart Materials in Medicine 2023, 4, 146-159. https://doi.org/10.1016/j.smaim.2022.09.002 (CiteScore2021 5.2, Q1).
- Kosheleva, N.V.; Efremov, Y.M.; Koteneva, P.I.; Ilina, I.V.; Zurina, I.M.; Bikmulina, P.Y.; Shpichka, A.I.; Timashev, P.S. “Building a tissue: mesenchymal and epithelial cell spheroids’ mechanical properties at micro-and nanoscale”. Acta Biomaterialia 2022. https://doi.org/10.1016/j.actbio.2022.09.051 (CiteScore2021 15.6, Q1).
- Markov, A.; Gerasimenko, A.; Boromangnaeva, A.-K.; Shashova, S.; Iusupovskaia, E.; Kurilova, U.; Nikitina, V.; Suetina, I.; Mezentseva, M.; Savelyev, M.; Timashev, P.; Telyshev, D.; Liang, X.-J."Multilayered Organic Semiconductors for High Performance Optoelectronic Stimulation of Cells". Nano Research 2022, 1-8. https://doi.org/10.1007/s12274-022-5130-8 (CiteScore2021 15.2, Q1).
- Bikmulina, P.; Kosheleva, N.; Shpichka, A.; Yusupov, V.; Gogvadze, V.; Rochev, Yu.; Timashev, P. "Photobiomodulation in 3D tissue engineering," J. Biomed. Opt. 2022, 27(9), 090901 https://doi.org/10.1117/1.JBO.27.9.090901 (CiteScore2021 6.6, Q2).
- Korneev, A.; Lipina, M.; Lychagin, A.; Timashev, P.; Kon, E.; Telyshev, D.; Goncharuk, Yu.; Vyazankin, I.; Elizarov, M.; Murdalov, E.; Pogosyan, D.; Zhidkov, S.; Bindeeva, A.; Liang, X.-J.; Lasovskiy, V.; Grinin, V.; Anosov, A.; Kalinsky, E. “Systematic review of artificial intelligence tack in preventive orthopaedics: is the land coming soon?” International Orthopaedics 2022, 1-11. https://doi.org/10.1007/s00264-022-05628-2 (CiteScore2021 5.8, Q2).
- Gerasimenko, A.; Kuksin, A.; Shaman, Y.; Kitsyuk, E.; Fedorova Yu.; Murashko, D.; Shamanaev, A.; Eganova, E.; Sysa, A.; Savelyev, M.; Telyshev, D.; Pavlov, A.; Glukhova, O. “Hybrid Carbon Nanotubes-Graphene Nanostructures: Modeling, Formation, Characterization”. Nanomaterials 2022, 12 (16), 2812. https://doi.org/10.3390/nano12162812 (IF JCR 5.3, CiteScore2022 7.4, Q1).
- Ibragimova, S.; Medvedeva, E.; Romanova, I.; Istranov, L.; Istranova, E.; Lychagin, A.; Nedorubov, A.; Timashev, P.; Telpukhov, V.; Chagin, A. “Implantation of Various Cell-Free Matrixes Does Not Contribute to the Restoration of Hyaline Cartilage within Full-Thickness Focal Defects”. Int. J. Mol. Sci. 2022, 23, 292. https://doi.org/10.3390/ijms23010292 (IF JCR 5.6, CiteScore2022 7.8, Q1).
- Yang, Y.; Mai, Z.; Zhang, Y.; Yu, Z.; Li, W.; Zhang, Y.; Li F.; Timashev P.; Luan P.; Luo D.; Liang X. J.; Yu, Z. “A Cascade Targeted and Mitochondrion-Dysfunctional Nanomedicine Capable of Overcoming Drug Resistance in Hepatocellular Carcinoma”. ACS Nano 2023, 17 (2), 1275–1286. https://doi.org/10.1021/acsnano.2c09342 (IF JCR 17.1, CiteScore2022 25.4, Q1).
- Tu, Z.; Timashev, P.; Chen, J.; Liang, X. J. “Ferritin‐based drug delivery system for tumor therapy”. BMEMat 2023, e12022. https://doi.org/10.1002/bmm2.12022
- Polokhin, A.; Shaman, Y.; Itrin, P.; Panyaev, I.; Sysa, A.; Selishchev, S.; Kitsyuk E.; Pavlov A.; Gerasimenko, A. Y. “Tapered Optical Fiber Sensor Coated with Single-Walled Carbon Nanotubes for Dye Sensing Application”. Micromachines 2023, 14 (3), 579. https://doi.org/10.3390/mi14030579 (IF JCR 3.4, CiteScore2022 4.7, Q2).
- Popovich, K., Vagner, S., Murashko, D., Ten, G., Ryabkin, D., Savelyev, M., Kitsyuk E.; Gerasimanko E.; Edelbekova P.; Konovalov A.; Telyshev D.; Selishchev S.; Gerasimenko, A. “Stability and Thrombogenicity Analysis of Collagen/Carbon Nanotube Nanocomposite Coatings Using a Reversible Microfluidic Device”. Membranes 2023, 13 (4), 403. https://doi.org/10.3390/membranes13040403 (IF JCR 4.2, CiteScore2022 4.4, Q2).
- Antoshin, A.; Dubinin, O.; Miao, L.; Istranova, E.; Bikmulina, P.; Fayzullin, A.; Magdanov, A.; Kravchik, M.; Kosheleva, N.; Solovieva, A.; Sadchikova, E.; Kotova, S.; Efremov, Yu.; Qu, X.; Butnaru, D.; Evlashin, S.; Shpichka, A.; Liu, C.; Timashev P. “Semipermeable barrier-assisted electrophoretic deposition of robust collagen membranes”. J. Mater. Sci. 2023, 58, 9675–9697. https://doi.org/10.1007/s10853-023-08641-x (IF JCR 4.5, CiteScore2022 7.7, Q1).
- Kazak, A.; Nikitin, K.; Marchenkova, M.; Savelyev, M.; Vasilevsky, P.; Gerasimenko, A.; Chausov D.; Kholodkov I.; Usol'tseva N.; Tolbin, A. “Langmuir-Schaefer films based on cyclotriphosphazene-substituted phthalocyanines: supramolecular organization, UV/Vis study, and laser-induced nonlinear absorption”. Appl. Surf. Sci. 2023, 638, 158077. https://doi.org/10.1016/j.apsusc.2023.158077 (IF JCR 6.7, CiteScore2022 12.7, Q1).
- Pospelov A.; Kutova O.; Efremov Yu.; Nekrasova A.; Trushina D.; Gefter S.; Cherkasova E.; Timofeeva L.; Timashev P.; Zvyagin A.; Balalaeva I. “Breast Cancer Cell Type and Biomechanical Properties of Decellularized Mouse Organs Drives Tumor Cell Colonization”. Cells 2023, 12 (16), 2030. https://doi.org/10.3390/cells12162030 (IF JCR 6.0, CiteScore2022 9.0, Q1).
- Timakova, A.; Ananev, V.; Fayzullin, A; Makarov, V.; Ivanova, E; Shekhter, A.; Timashev, P. “Artificial Intelligence Assists in the Detection of Blood Vessels in Whole Slide Images: Practical Benefits for Oncological Pathology”. Biomolecules 2023, 13 (9), 1327. https://doi.org/10.3390/biom13091327 (IF JCR 5.5, CiteScore2022 8.3, Q1).
- Belikov, N.; Pushkarev, A.; Tsiganov, D.; Khaydukova, I.; Gafarova, E.; Korneev, A.; Kurkov A.; Shekhter A.; Timashev, P. “Freeze-thaw sheep pericardium decellularization without detergents: a pilot study”. Materialia 2023, 101909. https://doi.org/10.1016/j.mtla.2023.101909 (CiteScore2022 6.1, Q1).
Патенты
Патент РФ на изобретение № 2785136 Способ получения матрикс-связанных везикул из монослойных культур клеток и клеточных сфероидов. Авторы: Бутнару Д.В., Тимашев П.С., Пешкова М.А., Кошелева Н.В., Власова И.И., Бикмулина П.Ю., Шпичка А.И. Приоритет изобртения 12.11.2021г.
Патент РФ на изобретение №2802348 Способ очистки однослойных углеродных нанотрубок. Авторы: Власова И.И., Сулейманов Ш.К., Ключерев Т.О., Кошелева Н.В., Тимашев П.С. Приоритет изобретения 21.02.2023г.
Патент РФ на изобретение №2797350 Пленочный датчик для неинвазивной регистрации магнитного поля в биологическом объекте. Авторы: Ичкитидзе Л.П., Герасименко А.Ю., Савельев М.С., Телышев Д.В., Галечян Г.Ю. Приоритет изобретения 07.09.2022г.
Учебно-методический комплекс
- Регенеративная медицина: учебник / под ред. П. В. Глыбочко, Е. В. Загайновой. – Москва : ГЭОТАР-Медиа, 2023. – 456 с. : ил. - DOI: 10.33029/9704-7535-5-REG-2023-1-456. ISBN 978-5-9704-7535-5.
- Регенеративная медицина: практикум: учебное пособие / под ред. П. В. Глыбочко, Е. В. Загайновой. – Москва : ГЭОТАР-Медиа, 2023. – 144 с. : ил. - DOI: 10.33029/9704-7389-4-REG-2023-1-144. ISBN 978-5-9704-7389-4.
Учебно-методические пособия
- Основы биомедицинской статистики: учебно-методическое пособие / А.Д. Куренкова, А.И. Шпичка, П.С. Тимашев; ФГАОУ ВО Первый МГМУ имени И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет). – М. : Издательство Сеченовского Университета, 2023. – 60 с. : илл. ISBN 978-5-89152-096-7.
- Гистологическое и иммуногистохимическое окрашивание тканей: учебно-методическое пособие / А.Д. Куренкова, Н.Б. Сережникова, Н.В. Кошелева, А.И. Шпичка, П.С. Тимашев; ФГАОУ ВО Первый МГМУ имени И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет). – М. : Издательство Сеченовского Университета, 2023. – 64 с. : илл. ISBN 978-5-89152-095-0.
Конференции
Международные конференции
- 19Th ESSKA Congress, May 11-15 2021, Virtual
- XXXVII Международная научно-практическая конференция “Advances in Science and Technology”, June 15 2021, Moscow, Russia
- the Vth Sechenov International Biomedical Summit 2021 (SIBS-2021), November 9-10, 2021, Moscow, Russia https://sechenov-sibs.confreg.org/programma/
- Международный конгресс «Артромост 2021», Ноябрь 27 2021, Москва, Россия www.artromost.ru
- Russian-Chinese Symposium “Future Orthopedics: Nanotechnology and AI”, November 30, 2021, Russia-China, Online
- 10th Anniversary International Conference on "Physics and Mechanics of New Materials and Their Applications" (PHENMA 2021-2022), May 23 – 27, 2022, ) Divnomorsk, Krasnodar region, Russia ) https://phenma2021.sfedu.ru/
- ISCOMC (International Student Congress of (Bio)Medical Science), 8-10 June, 2022, Groningen, Netherlands, Online https://iscoms.com
- VIII Euro-Asian Symposium “Trends in Magnetism” (EASTMAG-2022), August 22-26, Zavoisky Physical-Technical Institute of the Federal Research Center "Kazan Scientific Center of the Russian Academy of Sciences", Kazan, Russia http://eastmag2022.knc.ru/
- the VIth Sechenov International Biomedical Summit 2022 (SIBS-2022), November 8-9, 2022, Moscow, Russia https://sechenov-sibs.confreg.org/programma/
- II Russian-Chinese Symposium “Future Orthopedics: Nanotechnology and AI”, November 9, 2022, Russia-China, Online https://ortho.confreg.org/
- Regenerative Medicine International Symposium; Chronic and Degenerative Diseases, December 6, 2022, Tehran, Iran
- IV Международная молодёжная школа «Инновационные ядерно-физические методы высокотехнологичной медицины», с 28 июня по 01 июля 2023г., Калужская область, Россия https://protonschool.lebedev.ru/
- ChinaNano 26-28 August 2023 http://www.chinanano.org.cn/en/
- IEEE Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine (CSGB), September 28-29 2023, Novosibirsk and Yekaterinburg, Russia https://csgb.ieeesiberia.org/
- 2023 International Conference on "Physics and Mechanics of New Materials and Their Applications" (PHENMA 2023), October 03-08, 2023, Surabaya, Indonesia, https://phenma2023.sfedu.ru/
- III Russian-Chinese Symposium “Future Orthopedics: Nanotechnology and AI”, November 9, 2023, Russia-China, Online https://ortho.confreg.org/
- VIIth Sechenov International Biomedical Summit 2023 (SIBS-2023), November 8-9, 2023, Moscow, Russia https://sechenov-sibs.confreg.org/
- III Международная конференция «StemCellBio-2023: Трансляционная медицина – спектр возможностей». 17-18 ноября 2023б Санкт-Петербург, Россия http://stemcellbio.ru/
Российские конференции
- IX Научно-практическая конференция «Приоровские чтения» совместно с II Конгрессом ОРТОБИОЛОГИЯ «Регенеративные технологии в травматологии и отртопедии с позиций доказательной медицины», Апрель 23-24 2021, Москва, Россия: orthobio.ru
- Форум и Конференция «Наука будущего – наука молодых», секция НЦМУ «Науки о жизни», Ноябрь 18 2021, Москва, Россия https://sfy-conf.ru/
- Конгресс молодых ученых, Декабрь 8-10 2021, «Сириус», Сочи, Россия https://xn--d1acaa0afldb6c3b6bf.xn--80afdrjqf7b.xn--p1ai/
- Медицинская Весна, 19-20 Мая, Сеченовский Университет, Москва, Россия https://medspring.confreg.org
- VII Всероссийский молодежный научный форум «Наука будущего – наука молодых» 24 августа 2022, Новосибирск, Россия https://sfy-conf.ru/
- Семинар «Современные тренды в биофотонике 2023», 3–5 июля 2023 года, Институт прикладной физики им. А.В. Гапонова-Грехова, Нижний Новгород, Россия https://ctb2023.ipfran.ru/
- VII Всероссийская научно-практическая конференция «3D-технологии в медицине» 17 февраля 2023, Нижний Новгород Россия, https://nn-terra.ru/index.php?id=832&idx=print-event
- Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Медицинская весна - 2023», Москва, Россия https://medspring.confreg.org/
- Научно-практическая конференция «Абрикосовские чтения» (Москва, 19-20 мая 2023) https://nn-terra.ru/index.php?id=907&idx=print-event
- VIII Всероссийский молодежный научный форум «Наука будущего – наука молодых» (Орел, 20-23 сентября 2023) https://sfy-conf.ru/
- XXIV съезд Физиологического Общества им. И.П. Павлова (Санкт-Петербург, 11-15 сентября 2023 г.) https://rusphysiol2023.iephb.ru/
- Всероссийская научная школа-семинар «Взаимодействие СВЧ, терагерцового и оптического излучения с полупроводниковыми микро- и наноструктурами, метаматериалами и биообъектами» 2023, май 24-25, 2023, Саратов, Россия https://www.metananobio.ru/
Китайские конференции
- The National Polymer Academic Paper Series Conference, September 22-26, Beijing, China https://polymerchina.com.cn/?page=430489&
- China-Korea Young Scientist Forum 2021 October 11-14, 2021, Shanghai, China http://2021.csbm.org.cn/index.php/index/index/index.html
- Sino-German Workshop “New nanomaterials for biomedical applications” October 15-19, 2021, Shanghai, China https://www.x-mol.com/groups/rqhuang/news/20793
- The 14th Chinese Pharmaceutical Conference, Annual Meeting of China Local Chapter, Controlled Release Society, December 10-12, 2021, Shangri-La, Shenyang, Liaoning Province, China https://www.micecube.com/event/KwkJBM
Спецкурсы
- Дисциплина Биодизайн и персонализированное здравоохранение Модуль 1. «Основы эмбриологии млекопитающих». Направление подготовки 31.05.02 Педиатрия, 2 курс, профиль подготовки 31.00.00 Клиническая медицина
- Дисциплина Биодизайн и персонализированное здравоохранение Модуль 3. «Общая тканевая инженерия». Направление подготовки 31.05.02 Педиатрия, 4 курс, профиль подготовки 31.00.00 Клиническая медицина
- Дисциплина Биодизайн и персонализированное здравоохранение Модуль 5 «Основы вспомогательных репродуктивных технологий». Направление подготовки 31.05.02 Педиатрия, 2 курс, профиль подготовки 31.00.00 Клиническая медицина
- Дисциплина «Клеточная биология с основами эмбриологии» для студентов центральной магистерской программы по специальности «Биология», профиль «Синтетическая биология».
- Дополнительная профессиональная программа повышения квалификации «Введение в 3D биопечать» для биологов, биотехнологов, провизоров, врачей лечебных специальностей.
Семинары и мероприятия
- Онлайн-вебинар с применением платформы Zoom, посвященный формированию Лаборатории клинических смарт-нанотехнологий, Декабрь 22, 2020
- в рамках выполнения Проекта проходят регулярные онлайн-семинары с применением платформы Zoom «Modern Advances in Biomedicine and Biophotonics
Организаторы семинара:
- ФГАОУ ВО Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова Минздрава РФ (Сеченовский Университет), Научно-технологический парк биомедицины, лаборатория клинических смарт-нанотехнологий;
- ФГБОУ ВО «Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова», Междисциплинарная научно-образовательная школа "Фотонные и квантовые технологии. Цифровая медицина";
- ФГБОУ ВО «Приволжский исследовательский медицинский университет» Минздрава РФ и ФГАОУ ВО «Национальный исследовательский Нижегородский государственный университет им. Н.И. Лобачевского» Информация о семинарах доступна по ссылке (https://t.me/+mlqx1_dWqPphZWYy)
- Сотрудники лаборатории активно участвуют в регулярных онлайн - заседаниях с применением платформы Zoom регулярного научного семинара Института регенеративной медицины. Информация о семинарах доступна по ссылке (https://t.me/+6FF52j8p6UdkMTky)
Сотрудники лаборатории активно участвуют в регулярных онлайн - заседаниях с применением платформы Zoom регулярного научного семинара Института регенеративной медицины. Информация о семинарах доступна по ссылке (https://t.me/+6FF52j8p6UdkMTky)
Вклад в развитие ВУЗа и российского исследовательского общества
Сотрудники лаборатории активно участвуют в образовательном процессе в Сеченовском Университете, в том числе в обучении специалистов в области регенеративной медицины. Разработан и в сентябре 2022 г. издан первый отечественный учебно-методический комплекс по регенеративной медицине, включающий учебник и практикум по основам регенеративной медицины, предназначенный для студентов и преподавателей медицинских и биологических специальностей высших учебных заведений, а также работающих в смежных областях специалистов. В 2023 году подготовлены учебно-методические пособия по Основам биомедицинской статистики и Гистологическому и иммуногистохимическому окрашиванию тканей.
Лаборатория подразумевает консолидацию передовых технологий в области биомедицины, нанотехнологий, инженерии, наук о материалах и ортопедии и представляет собой наглядную реализацию мирового тренда междисциплинарного сотрудничества для решения глобальных вызовов современности.
Работа лаборатории направлена на разработку персонализированных решений в области регенеративной медицины и наномедицины, а ожидаемые результаты внесут значительный вклад в реализацию ее приоритетов в ближайшие годы. Участие Ведущего ученого профессора Лянь Син-Цзе и Ведущего ученого Тимашева Петра Сергеевича в образовательной деятельности Университета, а также привлечение ключевых исполнителей проекта для молодежных международных школ и мастер-классов по направлению таргетных нанотехнологии способствует эффективной интеграции Университета в мировое научное сообщество, повышению уровня образования и востребованности выпускников Университета среди ведущих мировых научных центров и промышленных корпораций. Наличие одной из крупнейших в России клинической базы, мощной и обновляемой научно-исследовательской инфраструктуры (включая функционирующую чистую зону и Биобанк по стандарту GMP, виварий – GLP), готовность к внедрению инновационных технологий в систему здравоохранения обосновывает целесообразность развития лаборатории на базе Сеченовского Университета.
Статистика и индикаторы
№ | Наименование показателя | Ед. изм. | 2021 год | 2022 год | 2023 год | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Плановые значения | Фактические значения | Плановые значения | Фактические значения | Плановые значения | Фактические значения | |||
1 | Количество лабораторий мирового уровня под руководством ведущих ученых с мировым именем, в том числе соотечественников, проживающих за рубежом | ед. | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
2 | Количество кандидатов наук, постоянно работающих в составе научного коллектива лаборатории | чел. | 5 | 5 | 5 | 6 | 5 | 7 |
3 | Количество аспирантов, обучающихся в образовательной организации или научной организации, на базе которой проводится научное исследование, и постоянно работающих в составе научного коллектива лаборатории | чел. | 3 | 3 | 3 | 5 | 3 | 4 |
4 | Количество студентов, обучающихся в образовательной организации, на базе которой проводится научное исследование, и постоянно работающих в составе научного коллектива лаборатории | чел. | 3 | 6 | 3 | 5 | 3 | 4 |
5 | Количество статей ведущего ученого в научных изданиях, индексируемых в базе данных Web of Science Core Collection, написанных совместно с работниками лаборатории по заявленному направлению исследования либо самостоятельно написанных работниками лаборатории, по заявленному направлению научного исследования, | ед. | 5 | 8 | 5 | 7 | 10 | 8 |
в том числе количество статей в научных изданиях, входящих в первый квартиль (Q1) по импакт-фактору соответствующего JCR базы данных Web of Science Core Collection | ед. | 4 | 6 | 4 | 5 | 7 | 5 | |
в том числе количество статей в научных изданиях, входящих во второй квартиль (Q2) по импакт-фактору соответствующего JCR базы данных Web of Science Core Collection | ед. | 1 | 2 | 1 | 2 | 3 | 3 | |
6 | Количество новых образовательных программ, разработанных образовательной организацией или научной организацией и реализуемых по заявленному направлению научного исследования | ед. | 1 | 2 | 2 | 2 | 3 | 1 |
7 | Количество диссертаций на соискание ученой степени доктора наук, защищенных работниками лаборатории по заявленному направлению научного исследования | ед. | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 1 |
8 | Количество диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук, защищенных работниками лаборатории по заявленному направлению научного исследования | ед. | 0 | 0 | 0 | 0 | 3 | 1 |
9 | Количество работников, принятых на обучение в аспирантуру и направленных в докторантуру образовательной организации или научной организации, на базе которой проводится научное исследование, по заявленному направлению научного исследования | чел. | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 |
10 | Количество зарегистрированных объектов интеллектуальной собственности, авторами которых являются работники лаборатории, | ед. | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 2 |
в том числе количество патентов на изобретение, полезную модель или промышленный образец по направлению научного исследования, авторами которых являются работники лаборатории | ед. | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 2 | |
11 | Количество грантов, полученных за время выполнения научных исследований, руководителями которых являются работники лаборатории | ед. | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 |
12 | Количество договоров и (или) контрактов, исполненных работниками лаборатории за время выполнения научных исследований | ед. | 0 | 0 | 1 | 2 | 2 | 2 |